La Federación Española de Médicos Homeópatas recomienda, para una adecuada formación básica en Homeopatía, el Máster en Medicina Homeopática del IL3, Instituto de Formación Continua – Universitat de Barcelona , que en octubre 2010 empieza su 10ª edición, con una duración de dos años lectivos, organizado por la Academia Médico Homeopática de Barcelona, impartiendo una enseñanza de acuerdo al programa de docencia del Comité Europeo para la Homeopatía (ECH) con los criterios de enseñanza de la Homeopatía clásica, y con posibilidad de acceso al examen de la Faculty of Homepathy de Londres.

En el  Ilustre Colegio Oficial de Médicos de Madrid se venía realizando un Curso de Formación Médica Continuada en Homeopatía, con la colaboración de la Fundación Instituto Homeopático y Hospital de San José , de dos años de duración.
Además se recomiendan todos los cursos que se imparten en las diferentes comunidades autónomas organizados por las asociaciones que forman la F.E.M.H.